135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2189 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  100 
 
 		 413 aa  828    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  36 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  32.54 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  34.66 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  32.74 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  33.25 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.17 
 
 		 391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  31.28 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  32.25 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  30.26 
 
 		 406 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  31.19 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  32.58 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  31.22 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  30.1 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.43 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.74 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  31.38 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29.63 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  29.27 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  31.49 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  27.72 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  30.65 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  31.98 
 
 		 412 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  29.31 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  30.12 
 
 		 392 aa  147  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.69 
 
 		 418 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.98 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  31.45 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.95 
 
 		 385 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  29.41 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  31.68 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  31.98 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  29.64 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  29.56 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  39.83 
 
 		 259 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  30.05 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  28.81 
 
 		 454 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29.95 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  30.88 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  28.57 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  26.49 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  25.54 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  27.9 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.25 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  28.73 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  28.85 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  27.44 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  29.3 
 
 		 392 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  28.67 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  27.21 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  31.03 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  28.08 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.39 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  29.29 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.87 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.23 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  28.01 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  32.43 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  23.87 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  31.39 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  30.56 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  28.54 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  32.35 
 
 		 229 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  28.06 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.21 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  27.49 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  27.2 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.67 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.41 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  49 
 
 		 135 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.44 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  25.82 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  28.19 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  22.69 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  26.84 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.47 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.47 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  30.34 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  26.56 
 
 		 380 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  24.22 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.86 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  30.25 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  24.03 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.37 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.05 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.17 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  22.33 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  22.33 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  23.65 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.4 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  25.72 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.52 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.05 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  22.91 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.52 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  21.27 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  21.3 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.76 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.76 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>