163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1764 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
386 aa  787    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  73.25 
 
 
389 aa  591  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  72.18 
 
 
402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  56 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  51.61 
 
 
380 aa  391  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  50.92 
 
 
391 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  47.8 
 
 
388 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  48.4 
 
 
385 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  68.78 
 
 
259 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  45.55 
 
 
386 aa  332  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  44.36 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  41.76 
 
 
385 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  45.27 
 
 
392 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  41.99 
 
 
339 aa  271  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  37.36 
 
 
418 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  39 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  34.04 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  35.98 
 
 
421 aa  219  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  33.6 
 
 
474 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  33.6 
 
 
406 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  33.33 
 
 
416 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  31.67 
 
 
409 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  34.54 
 
 
415 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  34.78 
 
 
418 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  33.68 
 
 
415 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  34.45 
 
 
416 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  33.25 
 
 
426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  33.77 
 
 
406 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  31.64 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  32.32 
 
 
412 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  31.64 
 
 
406 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  33.92 
 
 
388 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  32.41 
 
 
412 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  31.93 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  31.52 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  32.01 
 
 
412 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  31.3 
 
 
417 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  31.09 
 
 
412 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  44.77 
 
 
229 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  33.95 
 
 
383 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  32.27 
 
 
388 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  31.89 
 
 
411 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  32.22 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  30.38 
 
 
454 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  31.74 
 
 
413 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  35.88 
 
 
392 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  33.16 
 
 
392 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  30.89 
 
 
415 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  28.61 
 
 
426 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  33.07 
 
 
390 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  34.43 
 
 
390 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  30.2 
 
 
430 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  32.62 
 
 
388 aa  142  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  31.68 
 
 
402 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.49 
 
 
425 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  33.75 
 
 
380 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  33.79 
 
 
441 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  32.41 
 
 
383 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  30.99 
 
 
382 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  32.73 
 
 
394 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  30.7 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  35.63 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  28.24 
 
 
436 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  33.84 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  33.72 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  28.29 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  50.42 
 
 
135 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  29.34 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  28.92 
 
 
382 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  32.74 
 
 
389 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  32.82 
 
 
389 aa  123  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  29.27 
 
 
390 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.14 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.32 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.67 
 
 
382 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  33 
 
 
350 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.26 
 
 
269 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.41 
 
 
377 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.51 
 
 
376 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.51 
 
 
427 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.51 
 
 
427 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.35 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.26 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.45 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  27.27 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25.39 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.13 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3441  AAA family ATPase  50.7 
 
 
81 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  24.93 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  27.62 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  25.63 
 
 
424 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  25.07 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.25 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  23.25 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  26.47 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  26.06 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.32 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  23.91 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  25.31 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.03 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>