142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0599 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  100 
 
 
380 aa  774    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  58.06 
 
 
383 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  54.76 
 
 
383 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  51.26 
 
 
384 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  51.57 
 
 
441 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  54.14 
 
 
350 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  42.78 
 
 
394 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  43.86 
 
 
390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  46.28 
 
 
387 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  41.73 
 
 
388 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  44.59 
 
 
390 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  46.07 
 
 
390 aa  275  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  46.26 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  43.38 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  43.44 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  44.24 
 
 
402 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  43.16 
 
 
394 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  43.89 
 
 
392 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  43.78 
 
 
389 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  39.84 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  43.19 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  33.82 
 
 
415 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  35.51 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.28 
 
 
391 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  31.77 
 
 
412 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  32.49 
 
 
386 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.26 
 
 
394 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  32.95 
 
 
415 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  35.61 
 
 
388 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  31.7 
 
 
418 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  30.95 
 
 
406 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  32.18 
 
 
392 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  30.73 
 
 
418 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  31.4 
 
 
406 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  33.79 
 
 
389 aa  150  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  30.51 
 
 
385 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  28.65 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  30.48 
 
 
407 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  30.17 
 
 
412 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  33.23 
 
 
380 aa  146  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  31.5 
 
 
406 aa  145  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30.52 
 
 
406 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  31.12 
 
 
417 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  33.23 
 
 
385 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  34.37 
 
 
402 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.68 
 
 
421 aa  143  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  31.5 
 
 
474 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.22 
 
 
426 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29.86 
 
 
409 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  29.44 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  31.69 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  30.58 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  27.95 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  25.94 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  25.69 
 
 
412 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  27.57 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  26.76 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  28.85 
 
 
413 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.97 
 
 
390 aa  109  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  28.65 
 
 
411 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  27.78 
 
 
378 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  27.36 
 
 
436 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  45.9 
 
 
139 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.21 
 
 
430 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.49 
 
 
415 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.98 
 
 
379 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.96 
 
 
386 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  24.88 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.96 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  26.7 
 
 
426 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.59 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.88 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.88 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  27.81 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.45 
 
 
380 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.26 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  30.65 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  31.95 
 
 
229 aa  90.1  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  28.01 
 
 
454 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.01 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.46 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.44 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.88 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.81 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  24.88 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  24.88 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  25.06 
 
 
407 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  25.84 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  25.44 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  25.87 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  25.43 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  25.14 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.82 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  21.01 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  25.49 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  24.55 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  24.55 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.13 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  25 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>