69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0922 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0922  ATPase  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  71.43 
 
 
394 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  64.12 
 
 
390 aa  169  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  64.12 
 
 
390 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  57.46 
 
 
390 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  59.23 
 
 
394 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  53.73 
 
 
389 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  54.41 
 
 
391 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  52.55 
 
 
387 aa  144  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  55.56 
 
 
392 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  58.02 
 
 
402 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  50.74 
 
 
389 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  52.59 
 
 
388 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  50.36 
 
 
392 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  48.51 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  53.28 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  50.82 
 
 
383 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  48.36 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  50 
 
 
350 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  49.18 
 
 
441 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  44.03 
 
 
388 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  45.9 
 
 
380 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  35.88 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  32.64 
 
 
418 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  31.29 
 
 
412 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  32.41 
 
 
418 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.68 
 
 
385 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  28.95 
 
 
426 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  34.09 
 
 
392 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  32.06 
 
 
392 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  33.59 
 
 
389 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  34.19 
 
 
388 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  29.93 
 
 
409 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.33 
 
 
391 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  32.76 
 
 
380 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  29.29 
 
 
408 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  27.82 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  30.88 
 
 
406 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  39.19 
 
 
119 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.03 
 
 
394 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  32.17 
 
 
402 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  28.48 
 
 
409 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  41.56 
 
 
418 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  30.6 
 
 
416 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  31.06 
 
 
406 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  29.85 
 
 
412 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  29.41 
 
 
474 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  27.07 
 
 
415 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.62 
 
 
386 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  31.03 
 
 
386 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  31.93 
 
 
385 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  29.77 
 
 
412 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  26.88 
 
 
412 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  27.61 
 
 
406 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  28.79 
 
 
406 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  29.92 
 
 
419 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  29.69 
 
 
398 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  28.26 
 
 
421 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  32.48 
 
 
402 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  30.09 
 
 
386 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  32.08 
 
 
395 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  30.09 
 
 
382 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.62 
 
 
408 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  26.57 
 
 
417 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.34 
 
 
377 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  42.42 
 
 
430 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.67 
 
 
436 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  34.25 
 
 
382 aa  40.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>