171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3137 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 418 aa  855    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  43.93 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  39.56 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  41.38 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  41.3 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  41.58 
 
 		 380 aa  289  6e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  40.94 
 
 		 406 aa  289  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  39.66 
 
 		 409 aa  285  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  39.41 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  40.57 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  40.46 
 
 		 385 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  39.62 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  38.86 
 
 		 389 aa  279  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  38.3 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  38.05 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  38.42 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  36.46 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  37.36 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  39.45 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  38.32 
 
 		 339 aa  240  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  32.52 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  32.27 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  34.24 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  34.89 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  31.77 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  31.84 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  35.62 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  33.58 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  33.58 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  33.09 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  33.92 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  32.54 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  32.35 
 
 		 412 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  31.48 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  29.31 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  33.5 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  31.59 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  32.86 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  28.99 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29.31 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  29.31 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  31.23 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  32.36 
 
 		 388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  32.1 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  33.97 
 
 		 388 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  32.49 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  33 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  33.09 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  31.47 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.62 
 
 		 425 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  30.41 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  33.08 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  28.64 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  37.56 
 
 		 259 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  27.82 
 
 		 436 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  31.41 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  30.73 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  30.81 
 
 		 390 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  29.24 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  30.73 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  30.69 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  40.11 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  32.35 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.61 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30.49 
 
 		 441 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  31.07 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  27.5 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  28.95 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  29.2 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.64 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  49.06 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.77 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.72 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.72 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  35.1 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.25 
 
 		 402 aa  106  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.9 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.7 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.83 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  26.03 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.19 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.16 
 
 		 382 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.48 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.77 
 
 		 382 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.53 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.73 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  25.87 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.14 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.53 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  24.92 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  24.92 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  25.54 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  26.3 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  24.54 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  23.02 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.93 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  25.65 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  25.65 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3441  AAA family ATPase  53.52 
 
 		 81 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>