125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1812 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  813    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  48.97 
 
 
416 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  51.19 
 
 
413 aa  359  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  47.57 
 
 
396 aa  351  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  46.43 
 
 
396 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  43.18 
 
 
394 aa  319  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  39.8 
 
 
400 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  26.46 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.62 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  27.71 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  26.5 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  26.52 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  26.45 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  25.37 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.43 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.67 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  24.18 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  26.08 
 
 
415 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  25.56 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  24.94 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  24.31 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.67 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.84 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.89 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.03 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25.48 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  25.94 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.07 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.36 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.47 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  22.53 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  21.67 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.43 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.87 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  24.14 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.92 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  23.26 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.24 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  25.19 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  24.94 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  24.46 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  22.37 
 
 
474 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  22.78 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.49 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  24.88 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  25.33 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  23.72 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  22.78 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  21.01 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  22.83 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  22.08 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  26.33 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.36 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.36 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  21.64 
 
 
477 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  22.55 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  24.3 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.26 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  22.78 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  22.44 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  19.28 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  21.73 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  22.84 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.26 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  24.3 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  24.81 
 
 
387 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  24.68 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  23.56 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.82 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  24.47 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  23.86 
 
 
417 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  25.09 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  22.34 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  23.43 
 
 
398 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  20.23 
 
 
458 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  23.24 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.04 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  24.74 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.24 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  22.78 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  23.58 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.74 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  23.1 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  22.35 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  23.32 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  21.88 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  23.65 
 
 
486 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  22.22 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  23.32 
 
 
383 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  23.1 
 
 
413 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  21.28 
 
 
409 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  21.43 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  22.5 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  24.1 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  24.24 
 
 
442 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  20.7 
 
 
477 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  23.27 
 
 
487 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.48 
 
 
506 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3482  hypothetical protein  29.93 
 
 
119 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.133762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>