150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0263 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  78.28 
 
 		 396 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  850    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  72.22 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  53.43 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  47.73 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  50.91 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  44.59 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  25.91 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  25.61 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1277  hypothetical protein  77.05 
 
 		 62 aa  97.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.266766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  25.34 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  24.11 
 
 		 406 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.97 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  27.03 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  26.05 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  27.05 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  23.7 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  25.14 
 
 		 425 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  24.47 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  23.19 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  23.56 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  23.63 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24.15 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  23.84 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.33 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.24 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.87 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.51 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3482  hypothetical protein  39.1 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.133762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.75 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.28 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  26.61 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  25.72 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  24.5 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.58 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  25.66 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  22.77 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.1 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  23.34 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.51 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.06 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  23.98 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  25.58 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  26.71 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.42 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  22.5 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  22.54 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  22.2 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  23.37 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  23.42 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.03 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.35 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.57 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  21.89 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.93 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  23.32 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.4 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  24.53 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  21.84 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.07 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  23.08 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  23.26 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  23.81 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  21.97 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  25.82 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.73 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  23.32 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  24.94 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  24.94 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  23.85 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  21.32 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  26 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  23.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  25.25 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.47 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  20.92 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  25.59 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  24.16 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  23.53 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  23.59 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.63 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  20.27 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.37 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  24 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  21.93 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.65 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.36 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.14 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.8 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.38 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  23.85 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  23.85 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.61 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  26.54 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  22.99 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  23.63 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  23.99 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  26.42 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>