150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0407 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  784    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  89.41 
 
 		 389 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  60.63 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  59.69 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  58.7 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  58.96 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  55.81 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  59.63 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  60.57 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  54.62 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  51.53 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  48.46 
 
 		 388 aa  325  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  44.16 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  42.35 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  41.73 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  43.19 
 
 		 380 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  43.32 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  41.73 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  43.32 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  40.52 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  31.83 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  33.06 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  31.85 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  34.89 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  32.98 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  32.2 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  31.5 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  32.1 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.93 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  31.82 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  32.84 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  31.34 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  30.99 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  53.73 
 
 		 139 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.85 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.91 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  33.33 
 
 		 385 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  28.35 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.53 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  32.92 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  29.2 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.53 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.97 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  31.73 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  27.73 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  31.49 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.82 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  31.62 
 
 		 415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  28.98 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  30.73 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  30.77 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  28.49 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  31.36 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  30.27 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  27.57 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  30 
 
 		 430 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  30.47 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.78 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.52 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.52 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.47 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  28.18 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  30.38 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  28.35 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  27.08 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  27.23 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.81 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  27.14 
 
 		 474 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  31.13 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.42 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.04 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  27.75 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.88 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.7 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.83 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  34.94 
 
 		 229 aa  89.7  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  28.07 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.02 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  28.14 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  27.11 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  27.52 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.35 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.27 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  37.06 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.11 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.11 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  26.23 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  24.08 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  24.94 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  38.79 
 
 		 119 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  27.58 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  25.27 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.34 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  29.58 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.32 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.77 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.47 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>