160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4042 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  762    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  53.99 
 
 		 379 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  54.28 
 
 		 378 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  42.74 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  41.44 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  28.49 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  25.68 
 
 		 436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  28.49 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  27.25 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.82 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  26.65 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  26.92 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  25.21 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  28 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  28.21 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.5 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  27.35 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  27.38 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  27.19 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  25.46 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  27.16 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  25.51 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  27.22 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  26.69 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.31 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  26.1 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  26.51 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.05 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  28.43 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  27.14 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  28.1 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.69 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  27.92 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  25.7 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  24.18 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  27.11 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  25.86 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  25.48 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  25.07 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  26.79 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  28.53 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  27.65 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  24.79 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  26.81 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  26.61 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.63 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  24.79 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  25.5 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  26.59 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.95 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  24.93 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  25.08 
 
 		 383 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  25.14 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  24.57 
 
 		 421 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  25.07 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24.48 
 
 		 418 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  24.92 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  25.87 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.93 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  23.36 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  25.59 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  25.58 
 
 		 474 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  27.15 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  26.86 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.69 
 
 		 486 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25.3 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.71 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.53 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  26.14 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.42 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.4 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  23.05 
 
 		 382 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  26.01 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.05 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.39 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.71 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  24.37 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  23.17 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.19 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  21.53 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  24.57 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  24.67 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  23.51 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  27.12 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  25.91 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  24.45 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.42 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.8 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  25.85 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  25.85 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  24.55 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  21.74 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  24.21 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.98 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  24.47 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.31 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  23.28 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.14 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.36 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>