180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2317 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  100 
 
 
418 aa  840    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  72.82 
 
 
415 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  71.5 
 
 
415 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  69.71 
 
 
416 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  47.22 
 
 
412 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  49.39 
 
 
407 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  46.72 
 
 
417 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  45.74 
 
 
406 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  46.32 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  46.08 
 
 
406 aa  355  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  44.31 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  44.31 
 
 
412 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  41.99 
 
 
416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  41.38 
 
 
411 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  38.97 
 
 
430 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  37.47 
 
 
454 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  36.39 
 
 
436 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  34.46 
 
 
426 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  34.06 
 
 
415 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  35.71 
 
 
388 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.28 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  33.49 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  36 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.13 
 
 
391 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  34.63 
 
 
389 aa  206  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  32.37 
 
 
380 aa  197  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  35.45 
 
 
402 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  29.61 
 
 
385 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.78 
 
 
386 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  29.31 
 
 
418 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  34.38 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  31.02 
 
 
406 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  32.05 
 
 
421 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  32.86 
 
 
409 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  32.34 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  30.53 
 
 
408 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  30.75 
 
 
474 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  28.71 
 
 
408 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  33.82 
 
 
407 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  32.35 
 
 
392 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.09 
 
 
426 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  30.13 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  28.9 
 
 
392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  32.58 
 
 
388 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  30.49 
 
 
388 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  37.5 
 
 
269 aa  159  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  28.92 
 
 
390 aa  156  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  28.97 
 
 
388 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  33.73 
 
 
392 aa  156  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  31.7 
 
 
380 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  29.72 
 
 
441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  27.59 
 
 
384 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  31.45 
 
 
412 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  28.67 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  33.06 
 
 
394 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  30.69 
 
 
413 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  30.27 
 
 
391 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  30.88 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  30.7 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  31.91 
 
 
402 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  31.3 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  27.91 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  31.2 
 
 
424 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  25.81 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.06 
 
 
390 aa  126  6e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  31.36 
 
 
389 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  29.68 
 
 
408 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.82 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  29.31 
 
 
417 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  29.79 
 
 
389 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  30.97 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.92 
 
 
376 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  28.53 
 
 
398 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  29.55 
 
 
424 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  27.18 
 
 
419 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  31.4 
 
 
427 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  29.66 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.63 
 
 
425 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  26.85 
 
 
382 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  27.27 
 
 
425 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  28.85 
 
 
382 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.67 
 
 
402 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.58 
 
 
379 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  28.85 
 
 
386 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.79 
 
 
378 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.91 
 
 
413 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  28.33 
 
 
402 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.12 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  23.64 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.4 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.72 
 
 
427 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.72 
 
 
427 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.31 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.39 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.41 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.82 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  28.4 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  23.6 
 
 
380 aa  89  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.43 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>