139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1860 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  47.58 
 
 
396 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  48.43 
 
 
413 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  46.46 
 
 
416 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  45.71 
 
 
396 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  43.18 
 
 
395 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  38.5 
 
 
400 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  26.75 
 
 
406 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  27.73 
 
 
406 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  26.43 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.56 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.88 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  25.83 
 
 
412 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  25.91 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.5 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.5 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  25.56 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.39 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  25.29 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.94 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  24.87 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.78 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.09 
 
 
378 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.41 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.41 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  23.82 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  25.84 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  23.88 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.11 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  23.34 
 
 
427 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  27.1 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  23.87 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.55 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  22.88 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.74 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  24.87 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  23.06 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  23.24 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  24.32 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  21.45 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  21.43 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  25.14 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  22.28 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  24.62 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  25.14 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.35 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  23.26 
 
 
430 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  21.43 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  23.27 
 
 
426 aa  67  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.07 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  22.03 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  24.63 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  22.22 
 
 
409 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  23.27 
 
 
471 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  24.05 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  26.23 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  21.97 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.62 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3482  hypothetical protein  29.92 
 
 
119 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.133762  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  24.03 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  21.12 
 
 
408 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  23.94 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  23.12 
 
 
423 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  21.97 
 
 
392 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  25.2 
 
 
430 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  21.83 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  25.77 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  20.94 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  22.41 
 
 
481 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  22.22 
 
 
339 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  22.75 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  22.22 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  22.58 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  23.19 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  23.02 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  20.33 
 
 
487 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.83 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  23.54 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  21.21 
 
 
399 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  24.7 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  24.11 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.86 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  24.92 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  21.71 
 
 
432 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  21.01 
 
 
477 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  20.94 
 
 
425 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.61 
 
 
486 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.56 
 
 
426 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  22.6 
 
 
418 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  24.62 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  23.48 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.34 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.73 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  21.21 
 
 
466 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.59 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0196  hypothetical protein  21.97 
 
 
431 aa  54.7  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  23.57 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  25.35 
 
 
428 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  25.35 
 
 
424 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>