152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3747 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  775    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  62.6 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  61.21 
 
 		 390 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  60.16 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  56.05 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  59.63 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  56.73 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  59.73 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  57.3 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  52.88 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  54.38 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  47.35 
 
 		 383 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  45.12 
 
 		 388 aa  305  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  45.96 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  46.76 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  44.6 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  46.28 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  44.08 
 
 		 441 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  39.47 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  39.58 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  42.77 
 
 		 350 aa  240  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  34.83 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  32.8 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  31.95 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  31.04 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  33.33 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  30.69 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  28.95 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  30.28 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30.02 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.28 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  32.55 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  28.92 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.7 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  30.49 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  30.39 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  52.55 
 
 		 139 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  34.78 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  27.6 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  32.61 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.81 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  29.71 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.81 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.63 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  29.83 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.33 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  32.52 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  29.17 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  30.75 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  29.26 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  29.4 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  28.23 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29.84 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.85 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29.68 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  27.56 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.87 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  55.08 
 
 		 119 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.47 
 
 		 425 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.43 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.4 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  27.74 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  29.29 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  26.27 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  27.04 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  28.43 
 
 		 454 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  27.56 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  27.08 
 
 		 474 aa  106  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.86 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  29.69 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.77 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  28.94 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  27.33 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  33.73 
 
 		 229 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.63 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.15 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  29.67 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.28 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  28.81 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  28.81 
 
 		 427 aa  94.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.48 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.69 
 
 		 377 aa  92.8  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.6 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.2 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  25.6 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.3 
 
 		 259 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.91 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  27.75 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  27.75 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.14 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  25.13 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  36.49 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  24.03 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.39 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.47 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  27.22 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  25.93 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.5 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.81 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  26.05 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>