88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1286 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
427 aa  875    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  42.79 
 
 
425 aa  340  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  44.76 
 
 
417 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  45.12 
 
 
402 aa  306  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  41.19 
 
 
417 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  34.45 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  33.87 
 
 
423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  32.79 
 
 
424 aa  183  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  33.94 
 
 
426 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  33.02 
 
 
424 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.88 
 
 
425 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.6 
 
 
423 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  31.46 
 
 
415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  29.63 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  31.4 
 
 
418 aa  111  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  29.67 
 
 
417 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  27.36 
 
 
416 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  28.21 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29.67 
 
 
415 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  27.23 
 
 
406 aa  96.3  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  27.12 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  28.06 
 
 
411 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  28.12 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.95 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  25.18 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.98 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  27.42 
 
 
412 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  25.87 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.3 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  26.81 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  24.73 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.56 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  25.48 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.73 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.18 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  23.97 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  26.1 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  26.2 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  24.06 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.86 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  24.21 
 
 
386 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  26.32 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  26.74 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.19 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  26.92 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  23.66 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  24.73 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  23.03 
 
 
384 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.94 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.29 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  22.51 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.66 
 
 
474 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  23.78 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  24.5 
 
 
389 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.93 
 
 
487 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.44 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  22.93 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.17 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  22.57 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  22.99 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.72 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  24.53 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  24.52 
 
 
380 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.04 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  26.04 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.62 
 
 
481 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  24.4 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  26.98 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  25.62 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  22.79 
 
 
426 aa  54.3  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  24.86 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  25.74 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  24.1 
 
 
385 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  27.78 
 
 
389 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.43 
 
 
382 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  22.19 
 
 
418 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  23.75 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  33.61 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  25.35 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.5 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.39 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  25.93 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  26.77 
 
 
382 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  19.67 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  19.67 
 
 
419 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  24.35 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.27 
 
 
259 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>