69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3053 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
423 aa  833    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  64.94 
 
 
425 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  53.66 
 
 
424 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  52.59 
 
 
423 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  52.97 
 
 
424 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  50 
 
 
408 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  51.29 
 
 
426 aa  355  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  36.28 
 
 
417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  33.49 
 
 
417 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  33.18 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  32.41 
 
 
425 aa  170  6e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  28.9 
 
 
427 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  30.55 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  28.47 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  30.58 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.84 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  29.93 
 
 
406 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  27.53 
 
 
406 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  29.02 
 
 
416 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  29.53 
 
 
417 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  28.95 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  27.91 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  28.09 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  28.42 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  28.14 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  27.51 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  25.42 
 
 
412 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  27.29 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.7 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.04 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.11 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  31.85 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.75 
 
 
408 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  25.07 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.4 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.2 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.99 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.27 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  25.25 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  24.18 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  25 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.33 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24.93 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.57 
 
 
474 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  26.05 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.55 
 
 
392 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.22 
 
 
385 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.63 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.92 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  21.56 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  26.72 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  22.53 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  26.22 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.19 
 
 
259 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  23.89 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  22.47 
 
 
421 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  23.24 
 
 
388 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  24.46 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  27.48 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  23.35 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  22.87 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.28 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  27.56 
 
 
441 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  25.69 
 
 
394 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  24.17 
 
 
388 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  22.89 
 
 
426 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.17 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  27.37 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  27.39 
 
 
413 aa  43.9  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>