163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0644 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  790    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  46.65 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  44.85 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  45.45 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  45.53 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  47.87 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  48.46 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  46.88 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  46.24 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  44.6 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  45.43 
 
 		 394 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  43.9 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  41.94 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  46.38 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  44.17 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  43.38 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  44.21 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  40.32 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  40 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  41.03 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  36.93 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.65 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  33.97 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  36.61 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  30.57 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  32.58 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  34.16 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  32.92 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  30.57 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  31.33 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  30.57 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  32.05 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  30.55 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  28.49 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  27.76 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  32.61 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29.16 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  31.46 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.95 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  31.71 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  30.61 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30.39 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.62 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  30.68 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  29.97 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  32.12 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.93 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  30.46 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.99 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  28.85 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  27.34 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  30.33 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  27.72 
 
 		 421 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  27.91 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  27.25 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  27.75 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  27.51 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  26.91 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  48.51 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  27.6 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  28.35 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  25.96 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.54 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  28.83 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.29 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.91 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.65 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.43 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.93 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  29.79 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.67 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.67 
 
 		 427 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  27.2 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.57 
 
 		 259 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  28.08 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  26.07 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.41 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.41 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.68 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  25.19 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.19 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  23.23 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.94 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  25.94 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  24.17 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.29 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.32 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.77 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  36.28 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  26.26 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.72 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  22.87 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  26.89 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  29.61 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.83 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  25 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  24.73 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  27.87 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  27.7 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>