91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1590 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
402 aa  825    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  45.12 
 
 
427 aa  306  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  38.54 
 
 
425 aa  265  8.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  39.26 
 
 
417 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  35.89 
 
 
417 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  33.98 
 
 
424 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  33.82 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  32.94 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  32.85 
 
 
424 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  31.89 
 
 
423 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.36 
 
 
425 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.14 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  29.18 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  30.68 
 
 
407 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  29.02 
 
 
406 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  27.56 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.76 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  27.02 
 
 
407 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.28 
 
 
412 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  29.87 
 
 
415 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  30.9 
 
 
416 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  28.69 
 
 
417 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  28.33 
 
 
418 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  29.12 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  28.49 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  26.1 
 
 
415 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.98 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  27.85 
 
 
339 aa  87.4  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  26.16 
 
 
454 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  26.97 
 
 
436 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  25.65 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  26.99 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.47 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  23.41 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.86 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.08 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  24.81 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  26.46 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.48 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  24.53 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.01 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  21.31 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  27.7 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  21.31 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  25.97 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  23.28 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  26.87 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.07 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.51 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  23.46 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  25.75 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  25.71 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  24.61 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  26.7 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  28.69 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  22.98 
 
 
477 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  28.69 
 
 
390 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.46 
 
 
269 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  27.9 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  25.28 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.46 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  24.76 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  27.25 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  26.5 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.41 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25.57 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  25.36 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  22.09 
 
 
477 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.48 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  21.88 
 
 
392 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  25.48 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  24.6 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  27.68 
 
 
391 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  26.24 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  24.31 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  27.58 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  24.92 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  24.25 
 
 
474 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  23.58 
 
 
420 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  24.72 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  23.58 
 
 
431 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.29 
 
 
259 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.47 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  23.46 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  21.94 
 
 
378 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  22.73 
 
 
380 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  26.15 
 
 
441 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  21.98 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  23.81 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  21.9 
 
 
427 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  21.9 
 
 
427 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>