146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1877 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  100 
 
 		 400 aa  807    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  52.57 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  35.77 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  34.26 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  35.95 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  29.01 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  30.68 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  27.75 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  31.23 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  27.18 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  26.68 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  27.43 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  26.83 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  30.88 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  30.23 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.85 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  29.5 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  26.26 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  26.26 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  27.82 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  27.37 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  25.25 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  28.5 
 
 		 431 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  28.5 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  25.58 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.59 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  25.57 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  28.38 
 
 		 466 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  24.75 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.83 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  24.29 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  25.56 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  25.37 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.6 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.64 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  26.09 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  26.09 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  25.74 
 
 		 542 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  24.81 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.29 
 
 		 435 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  31.73 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  28.53 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  29.19 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  25.62 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.85 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  23.04 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.36 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.78 
 
 		 486 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  26.83 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  28.43 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  25.3 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.01 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.29 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  29.94 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.43 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.43 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.82 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.14 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  25.32 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.14 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.19 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.64 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.86 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.32 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  24.4 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  29.3 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.21 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  24.63 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  26.22 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  26.52 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  25.52 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.29 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.28 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.22 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  23.95 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  25.24 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  23.88 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  23.42 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  24.73 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  24.36 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  22.87 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.6 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  23.45 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  21.11 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.23 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  25.37 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  24.32 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  23.01 
 
 		 543 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2768  AAA ATPase  33.09 
 
 		 141 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.41 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  24.27 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  23.24 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  23.74 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  21.6 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.45 
 
 		 391 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>