84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5229 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  100 
 
 
418 aa  852    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  30.7 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  31.52 
 
 
390 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  32.7 
 
 
390 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  32.45 
 
 
390 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  33.66 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  34.83 
 
 
387 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  31.89 
 
 
389 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  31.78 
 
 
394 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  31.94 
 
 
392 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  30.92 
 
 
402 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  31.83 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  29.68 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  30.73 
 
 
392 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  29.97 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  29.47 
 
 
441 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  32.95 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  28.82 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  28.93 
 
 
383 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  25.61 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  27.57 
 
 
380 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  27.19 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  26 
 
 
416 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  25.35 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.77 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  29.03 
 
 
411 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  26.81 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  29.01 
 
 
350 aa  90.1  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  26.19 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  26.17 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  27.21 
 
 
418 aa  86.3  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  24.46 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  24.69 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  25.19 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  27.49 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  27.49 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  28.72 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  24 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  24.6 
 
 
474 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  21.93 
 
 
409 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.65 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.53 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  24.93 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.4 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.05 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24.54 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  32.64 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  23.8 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.02 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.44 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  23.66 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  25.48 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  22.89 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.63 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  25.84 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.85 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.07 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  22.45 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.2 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  24.28 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.76 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.14 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  23.73 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  20.47 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  25.14 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  30.32 
 
 
229 aa  56.6  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.14 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  24.15 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  28.02 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  23.8 
 
 
376 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  22.84 
 
 
436 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  22.54 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  35.04 
 
 
119 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  21.86 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  25.93 
 
 
427 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.26 
 
 
259 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  21.98 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  21.78 
 
 
377 aa  46.6  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  20.95 
 
 
454 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  23.28 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  23.28 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 
821 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  28.81 
 
 
269 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  30.69 
 
 
802 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>