25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0413 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  55.08 
 
 		 387 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  42.02 
 
 		 394 aa  84.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  45.13 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  41.53 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  44.25 
 
 		 390 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  45.61 
 
 		 392 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  36.28 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  38.79 
 
 		 389 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  37.72 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  41.23 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  39.66 
 
 		 389 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  37.07 
 
 		 394 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  36.84 
 
 		 384 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  35.96 
 
 		 388 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  36.84 
 
 		 388 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  37.5 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  37.5 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  39.19 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  39.05 
 
 		 380 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  35.04 
 
 		 418 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  31.43 
 
 		 406 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  33.93 
 
 		 441 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  32.46 
 
 		 418 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>