145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3833 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  97.43 
 
 		 390 aa  725    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  769    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  72.35 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  61.14 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  61.21 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  54.5 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  58.76 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  59.64 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  58.07 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  54.06 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  56.06 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  50.26 
 
 		 383 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  48.84 
 
 		 383 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  47.87 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  46.92 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  46.05 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  41.3 
 
 		 388 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  44.59 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  45.63 
 
 		 441 aa  288  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  44.76 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  45.59 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  32.7 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  34.33 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  34.03 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  33 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  31.58 
 
 		 426 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  64.12 
 
 		 139 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.83 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  31.03 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  35.1 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.23 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.6 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  29.02 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  30.9 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  33.76 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  34.01 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  33.91 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  32 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  32.11 
 
 		 416 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.07 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  33.24 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  31.13 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  32.07 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  29.14 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  28 
 
 		 406 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  30.09 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  27.3 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  31.89 
 
 		 415 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  32.38 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.02 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  30.17 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  32.78 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  28.72 
 
 		 421 aa  129  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  28.5 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  28.61 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  28.47 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  28.33 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  26.56 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  31.67 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  32.2 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.14 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  30.47 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  29.63 
 
 		 415 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.32 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  26.58 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  27.61 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  31.03 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  26.57 
 
 		 474 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  25.6 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  27.95 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  27.95 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  27.1 
 
 		 425 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  27.01 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  28.1 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.07 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  28.57 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  27.81 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  25.99 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  28.12 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  28.12 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.97 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.76 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.84 
 
 		 259 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  36.6 
 
 		 229 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  27.89 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.58 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  27.87 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  29.07 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  30.88 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  45.13 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  28.69 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.61 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.42 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  24.5 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  25.82 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.32 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.06 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.75 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.94 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>