143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1841 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1841  ATPase  100 
 
 
400 aa  817    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  45.57 
 
 
416 aa  362  4e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  44.42 
 
 
413 aa  342  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  42.64 
 
 
396 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  43.95 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  38.5 
 
 
394 aa  302  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  39.8 
 
 
395 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3482  hypothetical protein  45.21 
 
 
119 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.133762  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.78 
 
 
427 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.78 
 
 
427 aa  96.3  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  28.08 
 
 
388 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  28.05 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  26.13 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  28.36 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  25.22 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.98 
 
 
476 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  27.48 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.3 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.54 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.8 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.56 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.13 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  24.8 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  24.39 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  27.3 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  25.72 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  28.99 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.45 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  27.46 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  25.25 
 
 
486 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  29.07 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.86 
 
 
477 aa  77  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  26.61 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  25.21 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  24.87 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  22.35 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.43 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  22.53 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.71 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.38 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.59 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  23.92 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  24.48 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  27.86 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  25.9 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  24.78 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  26.12 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  27.78 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  26.81 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  21.87 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.8 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  21.93 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  25.45 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  26.48 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.09 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  24.6 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.53 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.65 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.07 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  26.77 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  24.62 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  25.19 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.22 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  24.38 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  27.62 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  25.07 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  23.75 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.8 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  26.53 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  21.57 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  24.1 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  26.35 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  26.35 
 
 
431 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24.82 
 
 
418 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  23.3 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  26.58 
 
 
466 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  21.77 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  24.62 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  23.82 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  24.11 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.39 
 
 
408 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  25.71 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  25.36 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  25.26 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  23.18 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.94 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  25.18 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  22.85 
 
 
426 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  24 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  23.53 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  25.27 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  19.01 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  22.59 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.14 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  23.35 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  24.04 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  22.74 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  24.93 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>