9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3482 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3482  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.133762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  45.21 
 
 		 400 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  38.1 
 
 		 416 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  39.1 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  35.34 
 
 		 396 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  34.35 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  29.92 
 
 		 394 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  29.93 
 
 		 395 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  35.48 
 
 		 389 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>