254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1901 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  100 
 
 
396 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  71.72 
 
 
396 aa  597  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  72.21 
 
 
413 aa  589  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  54.15 
 
 
416 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  45.71 
 
 
394 aa  371  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  43.95 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  46.43 
 
 
395 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  24.46 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25.2 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.2 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  23.85 
 
 
406 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  26.47 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  24.46 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  23.91 
 
 
406 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.02 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  24.44 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1277  hypothetical protein  62.3 
 
 
62 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.266766  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.08 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  26.89 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  22.8 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.86 
 
 
378 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  25.48 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  24.1 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  26.44 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  23.55 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  23.68 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.43 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  24.93 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  22.4 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.95 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  25.66 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  23.53 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3482  hypothetical protein  34.35 
 
 
119 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.133762  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.9 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  23.26 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  24.6 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.27 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.63 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  22.67 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  24.57 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  22.22 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  23.3 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  22.81 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  25.95 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  25.31 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  24.42 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.69 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.41 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  22.66 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  26.99 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  24.82 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.71 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  22.73 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  24.73 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  22.87 
 
 
385 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  21.02 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  23.48 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  24.2 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  25.61 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.68 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  23.1 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  22.29 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  20.93 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  23.72 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  22.16 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  24.12 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  24.29 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  23.31 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  22.85 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.89 
 
 
506 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  21.67 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  22.82 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  24.74 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  22.08 
 
 
481 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  23.72 
 
 
413 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  20.82 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  22.8 
 
 
409 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  20.57 
 
 
486 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  24.33 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  24.33 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  22.37 
 
 
474 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  24.48 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.42 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  22.13 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  23.96 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  24.87 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  24.16 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  20.21 
 
 
462 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  22.67 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  24.51 
 
 
376 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  22.31 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.91 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  27.48 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  22.75 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  20.98 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  23.46 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  25.44 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  22.71 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  23.6 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>