64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0125 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  100 
 
 
433 aa  899    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  40.56 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  41.57 
 
 
433 aa  325  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  40.74 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  40.57 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  41.12 
 
 
445 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  37.88 
 
 
449 aa  291  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  38.11 
 
 
445 aa  290  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  38.07 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  38.95 
 
 
447 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  33.87 
 
 
437 aa  256  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.49 
 
 
443 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  36.1 
 
 
443 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  36.49 
 
 
440 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  36.39 
 
 
437 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  33.79 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  36.87 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  35.8 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  36.14 
 
 
437 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  33.64 
 
 
435 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  34.32 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  31.51 
 
 
453 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  30.75 
 
 
455 aa  209  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  36.01 
 
 
437 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  33.48 
 
 
455 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  33.81 
 
 
442 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  28.67 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  32.19 
 
 
456 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.47 
 
 
457 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  28.6 
 
 
456 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  32.17 
 
 
452 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  28.89 
 
 
442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  31.65 
 
 
464 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  28.74 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  41.43 
 
 
210 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  28.41 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.94 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  22.22 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  28.64 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  28.64 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  51.06 
 
 
396 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  30.71 
 
 
379 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  21.33 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  25.51 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  24.07 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  29.13 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  25.68 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  45.28 
 
 
115 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.33 
 
 
476 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.88 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  24.23 
 
 
413 aa  47  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  27.92 
 
 
477 aa  46.6  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  21.91 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  26.76 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  22.5 
 
 
426 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.29 
 
 
485 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  23.81 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  22.59 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  28.57 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  22.59 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  26.9 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  22.63 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  22.7 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.91 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>