151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0011 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  100 
 
 
392 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  53.33 
 
 
390 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  53.76 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  55.81 
 
 
391 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  56.06 
 
 
390 aa  388  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  57.3 
 
 
387 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  55.26 
 
 
390 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  53.59 
 
 
394 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  54.76 
 
 
389 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  55.8 
 
 
389 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  51.86 
 
 
402 aa  342  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  45.53 
 
 
388 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  42.56 
 
 
388 aa  309  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  43.7 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  45.71 
 
 
383 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  43.24 
 
 
383 aa  294  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  41.29 
 
 
388 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  43.44 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  40.58 
 
 
384 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  40.22 
 
 
441 aa  249  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  40.06 
 
 
350 aa  225  9e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  33.81 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.01 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  31.94 
 
 
418 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.14 
 
 
391 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  34.83 
 
 
388 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  32.8 
 
 
402 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  32.17 
 
 
386 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  31.16 
 
 
392 aa  157  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  31.74 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  33.73 
 
 
418 aa  156  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  32.58 
 
 
389 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  31.41 
 
 
418 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  29.85 
 
 
380 aa  153  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  32.76 
 
 
339 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  31.95 
 
 
385 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.16 
 
 
386 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.96 
 
 
385 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  31.08 
 
 
416 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  29.81 
 
 
426 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  55.56 
 
 
139 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  33.16 
 
 
417 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30.35 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  33.86 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  29.65 
 
 
412 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  29.22 
 
 
406 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  28.76 
 
 
408 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  29.7 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  30.45 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  30.23 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.9 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  31.09 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  32.79 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  30.95 
 
 
425 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  28.61 
 
 
421 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  29.81 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  31.41 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  30.48 
 
 
436 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  30.1 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.34 
 
 
402 aa  117  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  27.15 
 
 
408 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  27.53 
 
 
406 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  26.2 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  27.57 
 
 
474 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  27.34 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  27.33 
 
 
379 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  28.1 
 
 
376 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.51 
 
 
377 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.27 
 
 
390 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.75 
 
 
393 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.61 
 
 
415 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.92 
 
 
427 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25.92 
 
 
427 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  28.65 
 
 
454 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  29.27 
 
 
407 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.99 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  28.06 
 
 
413 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.16 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.97 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.56 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  25.66 
 
 
380 aa  90.5  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  27.32 
 
 
419 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.23 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  27.32 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  29.05 
 
 
229 aa  86.7  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.5 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.32 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.32 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  45.61 
 
 
119 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  33.72 
 
 
269 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.58 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  27.5 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  25.55 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  25.14 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.94 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.2 
 
 
416 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  27.62 
 
 
400 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.27 
 
 
476 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  26.93 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.65 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>