158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0812 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  989    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  72.78 
 
 
481 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  67.49 
 
 
487 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  55.85 
 
 
543 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  55.52 
 
 
543 aa  343  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  40.62 
 
 
477 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  38.59 
 
 
477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.77 
 
 
486 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31 
 
 
476 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1917  hypothetical protein  59.7 
 
 
134 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.75 
 
 
485 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.48 
 
 
506 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  27.45 
 
 
435 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  23.71 
 
 
392 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.43 
 
 
388 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  22.88 
 
 
427 aa  95.1  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.88 
 
 
421 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  24.6 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  24.6 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  25.28 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.74 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  25.31 
 
 
415 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  24.88 
 
 
432 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  27.63 
 
 
417 aa  91.3  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  27.75 
 
 
414 aa  90.5  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  26.67 
 
 
410 aa  89.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  24.07 
 
 
462 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.34 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  26.13 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  25.3 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  24.88 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  26.8 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  24.64 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  25.25 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  24.83 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  26.35 
 
 
428 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  25.73 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  25.54 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  25.74 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  24.6 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  25.91 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  22.88 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  22.87 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.14 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  22.2 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  26.29 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  25.68 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  27.19 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  25.32 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.41 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  25.12 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  25.32 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  24.4 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.67 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  23.76 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  26.13 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  24.04 
 
 
423 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  22.77 
 
 
458 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  22.33 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  23.19 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  25.78 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  25.79 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  23.84 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  24.42 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  21.56 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  25.68 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.62 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  24.42 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  22.27 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.19 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  21.11 
 
 
416 aa  67  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  26.21 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  30.9 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  22.93 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  23.78 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  20.73 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.52 
 
 
406 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  26.72 
 
 
466 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  26.03 
 
 
542 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.48 
 
 
402 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.02 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  26.9 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  24.16 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  23.58 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  23.66 
 
 
388 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  27.31 
 
 
385 aa  61.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.32 
 
 
421 aa  60.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  25.44 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  21.66 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.33 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.33 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  21.16 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  25.61 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  21.78 
 
 
427 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  23.83 
 
 
411 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  24.37 
 
 
360 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  20.11 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  25.47 
 
 
407 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>