157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1016 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  100 
 
 
417 aa  831    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  69.66 
 
 
410 aa  558  1e-158  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  40.72 
 
 
413 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  33.57 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  34.04 
 
 
423 aa  206  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  33.02 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  34.7 
 
 
414 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  32.85 
 
 
403 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  32.91 
 
 
426 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  32.4 
 
 
471 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  33.03 
 
 
429 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  31.29 
 
 
428 aa  186  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  30.9 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  31.88 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  31.58 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  34.46 
 
 
413 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  35.05 
 
 
413 aa  179  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  33.84 
 
 
430 aa  176  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  32.73 
 
 
423 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  32.73 
 
 
423 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  32.59 
 
 
427 aa  170  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  32.15 
 
 
466 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  29.65 
 
 
428 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  31.31 
 
 
423 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2768  AAA ATPase  60.58 
 
 
141 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  33.07 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  31.87 
 
 
428 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  31.87 
 
 
424 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  33.01 
 
 
417 aa  160  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  33.01 
 
 
410 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  30.43 
 
 
423 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  29.33 
 
 
435 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  29.86 
 
 
432 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  29.93 
 
 
437 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  30.23 
 
 
400 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  29.37 
 
 
431 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  29.37 
 
 
420 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  27.13 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  29.21 
 
 
431 aa  140  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  29.16 
 
 
415 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  27.97 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  31.1 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  31.37 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  28.47 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  29.24 
 
 
542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  29.7 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  30.37 
 
 
418 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.98 
 
 
388 aa  107  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25 
 
 
390 aa  100  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  26 
 
 
392 aa  99.8  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  25.93 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  26.03 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  26.67 
 
 
487 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.34 
 
 
476 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  27.55 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  27.63 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.78 
 
 
486 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.27 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  23.93 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  25.64 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  24.86 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  23.74 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.45 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  24.72 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  31.82 
 
 
196 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  26.25 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  24.74 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  23.85 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.97 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.68 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.32 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.08 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  24.06 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  23.28 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.3 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  24.62 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.42 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  22.65 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.59 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  24.39 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  24.28 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25.6 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  24.68 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.6 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  22.65 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.82 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.65 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  24.36 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  23.78 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  25.13 
 
 
416 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  24.69 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  23.58 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  23.33 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  25.37 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  24.66 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  23.85 
 
 
383 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  20.81 
 
 
388 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  26.15 
 
 
396 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25 
 
 
259 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>