136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1105 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  100 
 
 
458 aa  904    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  47.07 
 
 
465 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  32.46 
 
 
501 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  30.03 
 
 
392 aa  176  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1373  hypothetical ATPase  31.25 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.96308  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1433  hypothetical protein  31.03 
 
 
436 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  28.39 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  28.39 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  29.85 
 
 
441 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2288  AAA ATPase  31.57 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  29.64 
 
 
421 aa  146  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.68 
 
 
477 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  24.67 
 
 
445 aa  103  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  24.67 
 
 
442 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.26 
 
 
477 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0961  hypothetical protein  24.67 
 
 
518 aa  94.4  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.416068  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0233  hypothetical protein  26.86 
 
 
380 aa  94  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.230022 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  24.34 
 
 
481 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.37 
 
 
486 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.88 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  22.82 
 
 
487 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  28.31 
 
 
388 aa  86.7  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  26.65 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.49 
 
 
485 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  23 
 
 
486 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  24.49 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  24.29 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  24.29 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  25.12 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  23.61 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  28.02 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  28.02 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.21 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  26.36 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  20.39 
 
 
506 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.69 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  27.98 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  24.74 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  27.98 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  24.63 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  25.2 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  24.5 
 
 
457 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  24.54 
 
 
427 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  25.54 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  26.79 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.54 
 
 
443 aa  64.3  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  24.87 
 
 
455 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  28.46 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.94 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  22.31 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.87 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  28.21 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.27 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  28.95 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.78 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  31.4 
 
 
399 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  24.05 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  26.16 
 
 
429 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  28.17 
 
 
401 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  34.44 
 
 
196 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  24.48 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  26.17 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  26.57 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.33 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.82 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  22.42 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.82 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  21.05 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  29.13 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  26.05 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  26.78 
 
 
425 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  23.98 
 
 
425 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  28.14 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  24.11 
 
 
412 aa  57  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  28.88 
 
 
401 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  21.13 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  23.41 
 
 
466 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.93 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.34 
 
 
400 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  28.31 
 
 
398 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  27.01 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  24.87 
 
 
376 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.12 
 
 
392 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  22.05 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  23.76 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  25.43 
 
 
339 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  22.65 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  20.55 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.01 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  22.4 
 
 
542 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  23.22 
 
 
415 aa  50.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.54 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  25.68 
 
 
414 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  24.68 
 
 
392 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  22.34 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.17 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.15 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.23 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  22.35 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>