132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1240 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  825    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  56.59 
 
 		 413 aa  408  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  56.12 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  35.78 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  33.96 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  35.82 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  28.61 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  33.58 
 
 		 466 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2796  AAA family ATPase  31.07 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  28.05 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  34.74 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  30.3 
 
 		 423 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  30.63 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  35.95 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  29.29 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  27.8 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  30.3 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  29.58 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  28.87 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2122  hypothetical ATPase  29.2 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.745714  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0062  putative ATPase  29.2 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  29.57 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  33.01 
 
 		 417 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0133655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  30.21 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  28.97 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  31.17 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  28.27 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2311  AAA family ATPase  30.4 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  27.48 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  27.48 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  29.59 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  27.36 
 
 		 432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  27.36 
 
 		 542 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  28.61 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  26.07 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  23.24 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  26.07 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  27.32 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  28.38 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  24.6 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.69 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  25.87 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  24.56 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4768  hypothetical protein  25.69 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4450  hypothetical protein  24.86 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0784759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.93 
 
 		 506 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  28.95 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1401  ATPase  28.95 
 
 		 196 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00484603  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  28.11 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.34 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1528  hypothetical protein  24.66 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000485459 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1040  AAA ATPase  25.84 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1618  AAA family ATPase  24.75 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  24.29 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.47 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  23.43 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  23.43 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  25.61 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  27.52 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.23 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.97 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  23.84 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.36 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  23.08 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.34 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.46 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  21.99 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.17 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0233  hypothetical protein  29.25 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.230022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  24.65 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  21.75 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  24.54 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  24.54 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2288  AAA ATPase  23.31 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.551072  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.72 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  22.31 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  24.57 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  23.7 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.17 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.17 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  26.3 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  23.44 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  23.31 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  20.95 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  25.9 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  29.2 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  29.2 
 
 		 543 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  24.72 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  22.28 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.58 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.5 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.51 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  27.36 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  23.76 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  22.82 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  23.7 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.22 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  25.35 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>