46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0547 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  819    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  34.41 
 
 		 429 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  33.42 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  31.27 
 
 		 413 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  29.27 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  26.77 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  26.61 
 
 		 401 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  23.92 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  23.65 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.03 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.95 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  27.84 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  27.97 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.84 
 
 		 477 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.53 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  27.2 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.43 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.16 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.05 
 
 		 506 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  24.6 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  22.03 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  23.76 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  26.46 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.58 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  21.8 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  23.53 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  22.18 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  20.83 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  20.83 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  24.48 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  22.5 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  22.5 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  30.82 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  25.45 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  19.54 
 
 		 485 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  24.91 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  21.8 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  23.69 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  24.34 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  25.78 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  20.68 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  22.5 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  21.95 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  26.67 
 
 		 543 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  26.67 
 
 		 543 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.23 
 
 		 434 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>