70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1506 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  77 
 
 
387 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  100 
 
 
387 aa  788    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  27.95 
 
 
401 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  27.95 
 
 
401 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  28.22 
 
 
399 aa  143  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  25.52 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  29.33 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  26.5 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  23.65 
 
 
398 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.01 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.62 
 
 
486 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.42 
 
 
477 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.64 
 
 
506 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  31.01 
 
 
430 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.2 
 
 
485 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.8 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.31 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.31 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  26.2 
 
 
413 aa  57.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.64 
 
 
431 aa  56.2  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  28.78 
 
 
378 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  25.6 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  24.33 
 
 
400 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  29.37 
 
 
390 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  22.99 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  25.29 
 
 
388 aa  50.4  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  23.21 
 
 
501 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  28.5 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  26.99 
 
 
543 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  26.99 
 
 
543 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  31.61 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  23.08 
 
 
486 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  23.24 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  27.27 
 
 
408 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  20.66 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25.07 
 
 
409 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  26 
 
 
409 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.39 
 
 
759 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.18 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  20.54 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  27.13 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  19.82 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  26.67 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  36.23 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  27.69 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  24.64 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  23.44 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  30.52 
 
 
416 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1376  hypothetical protein  23.16 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0599566  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  22.43 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.57 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  20.77 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35 
 
 
604 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  25.13 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3074  ABC transporter related  29.49 
 
 
239 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31 
 
 
639 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  35 
 
 
499 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35 
 
 
608 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  39.71 
 
 
806 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  30.71 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  39.44 
 
 
697 aa  43.5  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  30.83 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1956  hypothetical protein  32.2 
 
 
442 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  26.13 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0242  hypothetical ATPase  32.2 
 
 
445 aa  43.1  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.24 
 
 
727 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  34.78 
 
 
451 aa  43.1  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  32.71 
 
 
632 aa  42.7  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  34.65 
 
 
764 aa  42.7  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>