54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4144 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  100 
 
 		 429 aa  879    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  38.35 
 
 		 399 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  38.72 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  38.21 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  34.41 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  34.58 
 
 		 401 aa  239  9e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  34.35 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  26.71 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  25.29 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.22 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.6 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.36 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.97 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.72 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.75 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  26.1 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.19 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  28.7 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.42 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.29 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  22.7 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  21.8 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.78 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.17 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.75 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  21.13 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  26.23 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.16 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  27.27 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  21.8 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  26.37 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  23.84 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  23.84 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.3 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  20.75 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  30.67 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  28.99 
 
 		 543 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  25.61 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.36 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  28.99 
 
 		 543 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  25.24 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  24.84 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  25.56 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  23.21 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  21.9 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  25.35 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0184  hypothetical ATPase  21.61 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.932063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  34.45 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  24.91 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  20.97 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  23.64 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  31.75 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  22.96 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  23.51 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>