49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2166 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  100 
 
 
413 aa  844    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  54.72 
 
 
399 aa  457  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  38.72 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  41.04 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  33.58 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  31.27 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  33.08 
 
 
401 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  27.2 
 
 
387 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  26.25 
 
 
387 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.85 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.85 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.62 
 
 
486 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.05 
 
 
485 aa  63.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.56 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.95 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.9 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1782  hypothetical protein  22.9 
 
 
466 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0676133  normal  0.0484685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  23.4 
 
 
414 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.07 
 
 
393 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  28.03 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.73 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.3 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  26.26 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  28.79 
 
 
432 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.76 
 
 
471 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  21.35 
 
 
410 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  24.45 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  22.5 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.22 
 
 
376 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  29.19 
 
 
415 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  22.15 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  25.47 
 
 
427 aa  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  24.15 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  27.59 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  26.33 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  24.55 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  21.82 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  23.83 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  31.85 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.82 
 
 
435 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  22.22 
 
 
430 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.91 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  22.11 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3050  hypothetical protein  20.93 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.855105  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  29.86 
 
 
462 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  22.36 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  24.82 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  28.68 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  28.17 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>