51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0805 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  100 
 
 
399 aa  805    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2166  AAA ATPase  54.72 
 
 
413 aa  431  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4144  AAA ATPase  38.21 
 
 
429 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0785  AAA ATPase  39.33 
 
 
399 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.313428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  33.09 
 
 
401 aa  184  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  32.61 
 
 
401 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  29.27 
 
 
398 aa  162  9e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1555  AAA ATPase  28.47 
 
 
387 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.536767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1506  AAA ATPase  27.97 
 
 
387 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.235855  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.95 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  23.97 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  31.4 
 
 
458 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  31.89 
 
 
464 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.68 
 
 
477 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.57 
 
 
485 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.54 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.83 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.71 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.48 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  24.59 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  24.88 
 
 
487 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.4 
 
 
476 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  34.48 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  29.08 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  22.74 
 
 
425 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  24.11 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.94 
 
 
430 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  27.13 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.79 
 
 
435 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  26.88 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  24.26 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  27.78 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1262  AAA family ATPase  21.71 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  26.34 
 
 
486 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  22.94 
 
 
423 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  29.03 
 
 
490 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  24.33 
 
 
429 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1840  hypothetical protein  26.41 
 
 
501 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.61 
 
 
431 aa  46.6  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  23.58 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  26.52 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  24.18 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  22.58 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.49 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  22.05 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.53 
 
 
506 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  26.34 
 
 
481 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  23.44 
 
 
452 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  33.57 
 
 
462 aa  43.1  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  22.57 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  30.89 
 
 
413 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>