59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1843 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  927    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  49.21 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  47.01 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  39.91 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  36.66 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  36.06 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  37.56 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  38.21 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  38.21 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  32.31 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  32.62 
 
 		 450 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  32.16 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  31.44 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  32.94 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  30.97 
 
 		 447 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.97 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  32.55 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  29.89 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  29.54 
 
 		 445 aa  199  9e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  32.17 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  32.27 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  31.46 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  30.04 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  30.61 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  29.49 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  30.64 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  30.38 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  30.49 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  27.21 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  26.71 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.43 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  25.32 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.78 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.49 
 
 		 445 aa  116  8.999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  33.86 
 
 		 210 aa  97.8  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  23 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  25.86 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  25.92 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  26.56 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  20.73 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  26.57 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  25 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  53.19 
 
 		 115 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.38 
 
 		 392 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  22.81 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  23.64 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  26.83 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  30.46 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  25.5 
 
 		 471 aa  47.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  24.47 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  24.47 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.4 
 
 		 426 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  23.75 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  25.39 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.09 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  23.58 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.36 
 
 		 485 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  23.44 
 
 		 399 aa  43.5  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  29.29 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>