64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0181 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  916    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  44.4 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  42.83 
 
 		 453 aa  392  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  41.22 
 
 		 442 aa  342  8e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.35 
 
 		 437 aa  196  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  27.93 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  28.12 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  28.74 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.36 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  27.46 
 
 		 445 aa  153  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  27.63 
 
 		 449 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.96 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  25.78 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.95 
 
 		 433 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  26.49 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  25.67 
 
 		 450 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  25.33 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  24.89 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  24.72 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  24.18 
 
 		 452 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  23.09 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  23.74 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  23.94 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  24.62 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  25.19 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  25.22 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  25.5 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  24.78 
 
 		 437 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  24.34 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  24.47 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  23.5 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  24.12 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  25.83 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  24.44 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  24.88 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  25.28 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  21.66 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  23.26 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  24.65 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  22.53 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  26.47 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  24.94 
 
 		 388 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  22.89 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  21.59 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.57 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.89 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  23.04 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  22.39 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2215  hypothetical protein  22.72 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  20.58 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  28.49 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  22.22 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  23.96 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  25.26 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4874  ATPase  22.05 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.97 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.6 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  23.41 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  20.17 
 
 		 431 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  28.48 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  40.32 
 
 		 115 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  25 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  23.2 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>