75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10290 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  100 
 
 
443 aa  920    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  65.13 
 
 
433 aa  604  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  46.7 
 
 
437 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  46.01 
 
 
449 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  45.56 
 
 
445 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.84 
 
 
443 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  43.39 
 
 
450 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  44.7 
 
 
445 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  43.85 
 
 
447 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  41.36 
 
 
448 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  40.74 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  36.64 
 
 
435 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  36.64 
 
 
435 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  36.64 
 
 
434 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  34.24 
 
 
443 aa  233  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  33.82 
 
 
440 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.98 
 
 
437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  34.56 
 
 
437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  34.36 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  35.21 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  34.07 
 
 
437 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  33.9 
 
 
442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  33.65 
 
 
442 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  33.02 
 
 
457 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  34.07 
 
 
437 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  32.49 
 
 
456 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  32.94 
 
 
452 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  33.74 
 
 
464 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  30.09 
 
 
456 aa  186  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  29.28 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  40.67 
 
 
210 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  27.66 
 
 
455 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  26.79 
 
 
431 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  27.43 
 
 
445 aa  151  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.55 
 
 
442 aa  143  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  27.01 
 
 
463 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.65 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  23.19 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  25.25 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.06 
 
 
393 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  23.96 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  46 
 
 
115 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  25.54 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.53 
 
 
477 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  23.66 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  26.4 
 
 
477 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.79 
 
 
485 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  23.26 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  23.45 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  32.58 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  28.16 
 
 
460 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  28.16 
 
 
460 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1138  AAA family ATPase  22.96 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.631516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  25.41 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.09 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  26.27 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.26 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.2 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.43 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  20.05 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1378  hypothetical protein  24.11 
 
 
424 aa  46.6  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1319  hypothetical ATPase  24.11 
 
 
428 aa  47  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  23.33 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  22.52 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0167  hypothetical protein  22.74 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  23.7 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  22.99 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  21.6 
 
 
474 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.89 
 
 
506 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  21.52 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.1 
 
 
385 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  22.22 
 
 
388 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1240  hypothetical protein  26.51 
 
 
417 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  21.98 
 
 
409 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>