72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3692 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  902    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  77.67 
 
 
449 aa  718    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  48.12 
 
 
433 aa  438  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  46.7 
 
 
443 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  46.07 
 
 
445 aa  412  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  45.84 
 
 
450 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  44.39 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  43.22 
 
 
448 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  44.47 
 
 
447 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  40.05 
 
 
443 aa  334  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  40.57 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  36.24 
 
 
443 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  33.18 
 
 
435 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  33.33 
 
 
435 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  32.87 
 
 
434 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  33.99 
 
 
457 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  34.44 
 
 
455 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  31.53 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  33.56 
 
 
437 aa  223  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  33.71 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  32.74 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.59 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  32.65 
 
 
440 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  32.81 
 
 
437 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  32.28 
 
 
437 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  48.57 
 
 
210 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  32.24 
 
 
464 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  29.89 
 
 
452 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  29.95 
 
 
456 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  29.37 
 
 
437 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  29.36 
 
 
453 aa  176  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  28.13 
 
 
463 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  27.68 
 
 
445 aa  164  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.8 
 
 
455 aa  160  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.38 
 
 
431 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.46 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  23.53 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.53 
 
 
388 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  24.29 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  26.35 
 
 
360 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  25.26 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.38 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.32 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.38 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  24.4 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  23.9 
 
 
431 aa  51.2  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  24.32 
 
 
418 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  30.3 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.88 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  24.74 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.92 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.04 
 
 
485 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  23.4 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  21.65 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  31.9 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0463  hypothetical protein  23.61 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  25 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  23.93 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  36.05 
 
 
115 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.41 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  22.52 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1901  AAA ATPase  36.54 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0547156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  30 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  21.81 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  31.17 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2244  conserved hypothetical protein  22.6 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  24.09 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1877  AAA family ATPase  23.24 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.785569 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  21.97 
 
 
427 aa  43.9  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  22.28 
 
 
425 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  24.72 
 
 
434 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>