35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2879 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  46 
 
 		 443 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  44.07 
 
 		 448 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  46.15 
 
 		 445 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.33 
 
 		 442 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.14 
 
 		 433 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  53.19 
 
 		 452 aa  50.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  64.52 
 
 		 437 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  45.28 
 
 		 433 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  42.31 
 
 		 450 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  45.1 
 
 		 445 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  40.68 
 
 		 464 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  61.29 
 
 		 437 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  61.29 
 
 		 437 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  55.56 
 
 		 463 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  45.28 
 
 		 455 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  40.38 
 
 		 437 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  45.28 
 
 		 457 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  36.05 
 
 		 437 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  61.29 
 
 		 440 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  32.53 
 
 		 435 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  39.22 
 
 		 456 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  43.4 
 
 		 453 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  56.25 
 
 		 443 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  58.06 
 
 		 442 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  58.06 
 
 		 437 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  40.38 
 
 		 447 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  32.53 
 
 		 435 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  40.32 
 
 		 445 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  39.29 
 
 		 455 aa  42.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  44 
 
 		 456 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  41.18 
 
 		 434 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  36.07 
 
 		 442 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  42.37 
 
 		 443 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>