48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0843 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
453 aa  924    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  56.19 
 
 
455 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  42.83 
 
 
445 aa  388  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  43.56 
 
 
442 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  33.48 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  31.51 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  30.94 
 
 
445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  31.13 
 
 
448 aa  183  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  32.52 
 
 
456 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  30.64 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  29.42 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  28.54 
 
 
450 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  29.36 
 
 
437 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  29.28 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  28.57 
 
 
447 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  29.19 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  28.94 
 
 
443 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  28.5 
 
 
456 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  29.31 
 
 
443 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  25.32 
 
 
452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  25.32 
 
 
431 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  27 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  28.3 
 
 
437 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  25.56 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  28 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  26 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  26.87 
 
 
437 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  26.44 
 
 
437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  26.23 
 
 
442 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  26.45 
 
 
440 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  26.91 
 
 
442 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  25.61 
 
 
435 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  25.66 
 
 
434 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  24.89 
 
 
435 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  24.69 
 
 
463 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  28.57 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  20.86 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  20.4 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  22.66 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  22.75 
 
 
435 aa  46.6  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  23.61 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  43.4 
 
 
115 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1853  ATPase  29.56 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  29.59 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.58 
 
 
388 aa  43.9  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  27.1 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  22.77 
 
 
393 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  23.13 
 
 
426 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>