51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0470 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  91.74 
 
 		 440 aa  841    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  86.27 
 
 		 437 aa  805    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  908    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  98.4 
 
 		 437 aa  894    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  71.13 
 
 		 443 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  72.69 
 
 		 442 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  94.34 
 
 		 442 aa  867    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  95.88 
 
 		 437 aa  882    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  35.56 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  33.48 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  32.81 
 
 		 445 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  33.04 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  32.74 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  36.87 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  32.28 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  34.64 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  33.11 
 
 		 449 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  34.07 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.99 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  33.63 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  32.74 
 
 		 434 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  32.74 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  32.51 
 
 		 435 aa  193  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.49 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.22 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  29.59 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  31.55 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  30.49 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  29.26 
 
 		 456 aa  156  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  27.93 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  26.56 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  36.95 
 
 		 210 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  26.87 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.78 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  25.59 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.22 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  22.79 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  26.2 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  26.56 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  21.46 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  22.25 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  61.29 
 
 		 115 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.51 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.97 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  26.97 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  21.36 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  23.29 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.71 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.53 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  21.72 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>