46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1000 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 		 456 aa  951    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  32.1 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  32.34 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  32.92 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  32.19 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  29.93 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  29.95 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  28.48 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  30.09 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  31.4 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  31.16 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  32.52 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  30.77 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  30.24 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  27.48 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  31.45 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  29.26 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  29.91 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  29.78 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  30.22 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  29.48 
 
 		 437 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  27.1 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  29.26 
 
 		 437 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  27.38 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  30.02 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  29.23 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  29.02 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  26.71 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  28.54 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  27.4 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  26.28 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  26.72 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  26.8 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  24.39 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  27.62 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  34.38 
 
 		 210 aa  89.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.59 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  22.36 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  22.93 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  26.02 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  26.19 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.62 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  39.22 
 
 		 115 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  24.1 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.96 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  21.41 
 
 		 388 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>