37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0839 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  48.57 
 
 
437 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  43.33 
 
 
449 aa  197  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  42.72 
 
 
448 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  40.67 
 
 
443 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  39.71 
 
 
433 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  41.04 
 
 
445 aa  157  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  41.43 
 
 
433 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  39.25 
 
 
447 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  42.13 
 
 
443 aa  151  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  38.39 
 
 
445 aa  148  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  38.32 
 
 
450 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  35.47 
 
 
435 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  34.98 
 
 
435 aa  121  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  36.95 
 
 
437 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  36.95 
 
 
437 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  35.82 
 
 
440 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  37.5 
 
 
442 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  34.48 
 
 
434 aa  117  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  37 
 
 
437 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  36.68 
 
 
437 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  33.17 
 
 
457 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  34.34 
 
 
443 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  33.5 
 
 
455 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  32.77 
 
 
456 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  32.02 
 
 
442 aa  97.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  33.86 
 
 
452 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  28.97 
 
 
437 aa  95.5  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  31.16 
 
 
464 aa  92.8  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  34.38 
 
 
456 aa  89.7  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  31 
 
 
463 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  28.17 
 
 
455 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  28.85 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  28.57 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.75 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  25.79 
 
 
431 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  28.3 
 
 
423 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>