76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1411 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  100 
 
 
437 aa  909    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  33.87 
 
 
433 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  32.1 
 
 
456 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  33.48 
 
 
453 aa  226  4e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  31.44 
 
 
455 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  31.98 
 
 
443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  31.59 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  35.22 
 
 
443 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  30.02 
 
 
445 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  29.75 
 
 
442 aa  206  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  31.87 
 
 
433 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  32.35 
 
 
449 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  30.91 
 
 
445 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  29.6 
 
 
450 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  29.37 
 
 
437 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  31.03 
 
 
440 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  29.53 
 
 
445 aa  186  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  30.71 
 
 
447 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  31.37 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  30.79 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  31.22 
 
 
442 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  30.54 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  27.77 
 
 
443 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  31.22 
 
 
437 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  29.28 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  29.68 
 
 
457 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  28.76 
 
 
435 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  28.6 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  29.19 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  28.95 
 
 
442 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  25.74 
 
 
456 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  27.21 
 
 
452 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  26.54 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  25 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  28.97 
 
 
210 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  23.4 
 
 
463 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  22.47 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2125  ATPase  24.4 
 
 
432 aa  60.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000215621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  23.67 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1294  ATPase  24.03 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  24.15 
 
 
413 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1675  hypothetical protein  20.85 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103308  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  23.9 
 
 
409 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0677  putative ATP-binding protein  22.17 
 
 
426 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  22.73 
 
 
392 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  23.66 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.21 
 
 
408 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1502  hypothetical ATPase  22.17 
 
 
471 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.54545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  22.89 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  24.76 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  23.58 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  24.46 
 
 
481 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.6 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  21.08 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  21.96 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  24.17 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  22.46 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0096  hypothetical protein  24.19 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  23.01 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.3 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1454  ATPase  24.59 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal  0.145102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  22.43 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1375  hypothetical ATPase  23.72 
 
 
460 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0409041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1435  hypothetical protein  23.72 
 
 
460 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0367  hypothetical protein  24.46 
 
 
441 aa  46.6  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.795578  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  23.51 
 
 
423 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.02 
 
 
485 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1338  ATPase  21.61 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.422077  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0984  hypothetical protein  23.61 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.499582  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  40.38 
 
 
115 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  21.96 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.47 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  27.44 
 
 
486 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  28.16 
 
 
406 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2492  AAA family ATPase  21.35 
 
 
542 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  26.62 
 
 
413 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>