63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1185 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  914    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  61.35 
 
 
450 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  60.18 
 
 
445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  61.52 
 
 
447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  46.07 
 
 
437 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  46.31 
 
 
449 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  46.28 
 
 
433 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  44.7 
 
 
443 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  44.06 
 
 
448 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  41.5 
 
 
443 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  41.12 
 
 
433 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  34.9 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  34.38 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  34.38 
 
 
435 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  34.38 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  35.68 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  34.3 
 
 
440 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  32.74 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  33.18 
 
 
437 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  32.96 
 
 
437 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.03 
 
 
457 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  31.03 
 
 
455 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.37 
 
 
442 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  32.51 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  34.06 
 
 
442 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  32.34 
 
 
456 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  31.44 
 
 
452 aa  206  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  30.02 
 
 
437 aa  206  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  28.88 
 
 
464 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  29.42 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  27.47 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  28.41 
 
 
431 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  41.04 
 
 
210 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.55 
 
 
442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  25.34 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  26.27 
 
 
463 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.16 
 
 
390 aa  77  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  24.33 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.12 
 
 
477 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  23.13 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.46 
 
 
393 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  23.51 
 
 
360 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.14 
 
 
476 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  21.98 
 
 
485 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.63 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  29.72 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  21.23 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  31.18 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.37 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  45.1 
 
 
115 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  30.15 
 
 
376 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  20.4 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  23.04 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  24.67 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2802  hypothetical protein  23.58 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000105911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  20.36 
 
 
382 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  22.37 
 
 
388 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.47 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  25.13 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  22.14 
 
 
418 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  20.45 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3607  hypothetical protein  22.3 
 
 
434 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.593311 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  21.12 
 
 
384 aa  43.1  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>