57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2108 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  36.77 
 
 
455 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  37.45 
 
 
457 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  35.71 
 
 
464 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  36.66 
 
 
452 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  34.98 
 
 
435 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  34.57 
 
 
435 aa  216  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  30.57 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  34.15 
 
 
434 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  29.87 
 
 
448 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  28.13 
 
 
437 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  28.42 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  28.41 
 
 
433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  26.81 
 
 
449 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  27.53 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.85 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.01 
 
 
443 aa  143  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  29.89 
 
 
437 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  26.27 
 
 
445 aa  143  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  26.57 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  29.24 
 
 
442 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  28.6 
 
 
437 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  25 
 
 
445 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  27.93 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  27.93 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  27.93 
 
 
440 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  26.47 
 
 
443 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  28.44 
 
 
442 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  27.62 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.71 
 
 
455 aa  98.2  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.79 
 
 
442 aa  95.9  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  24.69 
 
 
453 aa  93.6  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  23.4 
 
 
437 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  31 
 
 
210 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  23.5 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.54 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  23.37 
 
 
408 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0812  hypothetical protein  27.92 
 
 
486 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000347749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  23.81 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  23.7 
 
 
408 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  23.51 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.68 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  23.02 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2963  ATPase  25.6 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.92 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.56 
 
 
391 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  24.05 
 
 
476 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  55.56 
 
 
115 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  23.98 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0084  hypothetical protein  25.68 
 
 
481 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.9 
 
 
426 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2566  hypothetical protein  27.27 
 
 
487 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.99 
 
 
393 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  22.45 
 
 
386 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  23.14 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  23.81 
 
 
477 aa  43.5  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  23.29 
 
 
392 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>