48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0814 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  69.18 
 
 
443 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  917    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  84.16 
 
 
437 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  94.34 
 
 
437 aa  867    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  95.25 
 
 
437 aa  876    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  95.02 
 
 
437 aa  878    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  89.34 
 
 
440 aa  827    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  71.17 
 
 
442 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  35.4 
 
 
448 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  32.44 
 
 
450 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  32.44 
 
 
445 aa  223  4e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  32.59 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  35.8 
 
 
433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  32.37 
 
 
445 aa  216  9e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  32.22 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  32.05 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  33.77 
 
 
456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.9 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.41 
 
 
443 aa  210  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  32.85 
 
 
433 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  33.71 
 
 
434 aa  203  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  32.81 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  33.04 
 
 
435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  30.6 
 
 
455 aa  190  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  31.26 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  31.22 
 
 
437 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  31.46 
 
 
452 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  31.91 
 
 
464 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  29.78 
 
 
456 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  29.24 
 
 
463 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  26.71 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  37.5 
 
 
210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  26.23 
 
 
453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.34 
 
 
445 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  24.52 
 
 
455 aa  99  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.69 
 
 
442 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.76 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0332  hypothetical protein  25.38 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0380917  normal  0.0135851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0180  hypothetical protein  26.56 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.825662  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  23.93 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1212  hypothetical protein  25.46 
 
 
427 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  24.39 
 
 
430 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0409  hypothetical protein  26.4 
 
 
423 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0483511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  58.06 
 
 
115 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1326  hypothetical protein  25.4 
 
 
445 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.71 
 
 
506 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1134  hypothetical protein  26.4 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  20.19 
 
 
406 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>