57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0745 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  71.3 
 
 		 450 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  914    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  72.81 
 
 		 447 aa  681    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  60.18 
 
 		 445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  46.03 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  44.39 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  45.56 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  42.83 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  42.29 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  36.96 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  38.11 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  32.37 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  33.86 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  32.81 
 
 		 437 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  32.21 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  32.81 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  32.81 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  32.58 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  30.35 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  34.23 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  32.44 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  34.07 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  33.99 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  31.32 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  29.54 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  29.53 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  28.48 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  30.94 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  26.05 
 
 		 464 aa  169  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  29.01 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  27.11 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.74 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  27.29 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  38.39 
 
 		 210 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.11 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  22.14 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  21.03 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  21.91 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.35 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1358  ATPase  24.44 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  25.12 
 
 		 477 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  26.87 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1187  hypothetical protein  20.41 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.391893  normal  0.175253 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  22.46 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  23.06 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0493  hypothetical protein  25.33 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  19.83 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  23.65 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  21.38 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  19.55 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  20.11 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0476  hypothetical ATPase  24.79 
 
 		 543 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1691  hypothetical protein  24.79 
 
 		 543 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  24.49 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>