38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2355 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  100 
 
 		 431 aa  887    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  28.67 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.03 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  28.41 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  27.11 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  28.41 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  27.7 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  28.99 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.79 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  26.4 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  27.38 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  26.7 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  27.08 
 
 		 455 aa  142  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  27.23 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  27.42 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  25 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  27.03 
 
 		 437 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  25.84 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  25.32 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  26.56 
 
 		 437 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  26.32 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  26.9 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  26.71 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.33 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  24.72 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  24.39 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  25.11 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  24.71 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  24.09 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  23.92 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  23.46 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  21.36 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  23 
 
 		 452 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  24.69 
 
 		 464 aa  90.1  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  23.5 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  21.6 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  25.79 
 
 		 210 aa  47.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0233  hypothetical protein  27.39 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.230022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>