73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2977 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2977  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  957    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171947  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0180  hypothetical protein  40.58 
 
 
455 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2294  hypothetical protein  40.83 
 
 
457 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1843  hypothetical protein  39.91 
 
 
452 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1391  hypothetical protein  36.26 
 
 
456 aa  294  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2108  hypothetical protein  35.71 
 
 
463 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0143  hypothetical protein  36.87 
 
 
435 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0593  hypothetical protein  36.87 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0774  hypothetical protein  36.27 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2367  hypothetical protein  34.38 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03690  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  34.56 
 
 
443 aa  219  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3692  hypothetical protein  32.24 
 
 
437 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000807501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0027  hypothetical protein  32.61 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0126035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10290  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  33.74 
 
 
443 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1185  hypothetical protein  28.88 
 
 
445 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.252763  normal  0.0547048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0055  ATPase  32.06 
 
 
450 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0454  hypothetical protein  29.65 
 
 
447 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.219111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01108  hypothetical protein  32.61 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0125  putative ATPase  31.65 
 
 
433 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0470  hypothetical protein  31.55 
 
 
437 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0814  hypothetical protein  31.91 
 
 
442 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0745  hypothetical protein  26.05 
 
 
445 aa  169  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000175072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2895  hypothetical protein  30.6 
 
 
437 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0367  hypothetical protein  30.44 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0298  hypothetical protein  30.07 
 
 
437 aa  166  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3559  hypothetical protein  30.26 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.856914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3125  hypothetical protein  30.42 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18710  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  30.34 
 
 
433 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.188824  normal  0.307627 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1411  putative AAA+ superfamily ATPase  26.54 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1000  putative AAA+ superfamily ATPase  26.8 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27760  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  27.4 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0843  putative AAA+ superfamily ATPase  28 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1213  hypothetical protein  26.26 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0181  hypothetical protein  24.64 
 
 
445 aa  100  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0839  putative AAA+ superfamily ATPase  31.16 
 
 
210 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.062546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2355  AAA family ATPase  24.69 
 
 
431 aa  90.1  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.11569  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  23.68 
 
 
406 aa  67  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  22.3 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.05 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0805  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase; type iidhqase)  31.89 
 
 
399 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.939667  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1666  AAA family ATPase  26.42 
 
 
477 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1823  hypothetical protein  27.69 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1105  AAA ATPase  22.42 
 
 
458 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  23.31 
 
 
402 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  24.13 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  23.47 
 
 
380 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0359  ATPase  27.31 
 
 
401 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  23.85 
 
 
409 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0739  AAA family ATPase  25.87 
 
 
477 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  23.99 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  25.91 
 
 
418 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  21.14 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  23.94 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0321  AAA ATPase  20.9 
 
 
465 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  23.42 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  23.74 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  22.86 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  23.52 
 
 
426 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  25.92 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  22.45 
 
 
413 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  29.77 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2879  hypothetical protein  40.68 
 
 
115 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0547  hypothetical protein  30.82 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  34.52 
 
 
400 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.13 
 
 
378 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  20.63 
 
 
409 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  24.28 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  22.02 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  29.2 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  25.64 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  23.4 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  24.82 
 
 
436 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  23.36 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>